Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms