Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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