Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SKP2Q13309 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SKP2Q13309 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SKP2Q13309 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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