Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHAF1AQ13111 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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