Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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