Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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