Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms