Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms