Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SREBF2Q12772 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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