Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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