Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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