Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms