Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms