Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms