Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms