Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms