Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RELQ04864 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RELQ04864 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RELQ04864 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms