Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms