Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms