Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms