Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ALDH6A1Q02252 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALDH6A1Q02252 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms