Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XPCQ01831 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XPCQ01831 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XPCQ01831 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XPCQ01831 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XPCQ01831 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms