Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP2B2Q01814 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP2B2Q01814 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms