Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms