Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MS4A2Q01362 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms