Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRF9Q00978 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms