Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms