Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-24P63145 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms