Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms