Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERFP50548 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERFP50548 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms