Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NESP48681 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NESP48681 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NESP48681 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NESP48681 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms