Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AFMP43652 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AFMP43652 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AFMP43652 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AFMP43652 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AFMP43652 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AFMP43652 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AFMP43652 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AFMP43652 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AFMP43652 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AFMP43652 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AFMP43652 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms