Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms