Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms