Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms