Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms