Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms