Protein–RNA interactions for Protein: P27986

PIK3R1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R1P27986 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3R1P27986 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms