Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
APCP25054 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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APCP25054 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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APCP25054 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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APCP25054 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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APCP25054 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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APCP25054 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
APCP25054 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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APCP25054 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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APCP25054 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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APCP25054 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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APCP25054 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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APCP25054 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APCP25054 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APCP25054 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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