Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HRCP23327 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRCP23327 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRCP23327 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HRCP23327 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HRCP23327 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms