Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK11BP21127 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms