Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SDSP20132 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SDSP20132 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SDSP20132 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms