Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms