Protein–RNA interactions for Protein: P18827

SDC1, Syndecan-1, humanhuman

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC1P18827 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDC1P18827 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SDC1P18827 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SDC1P18827 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SDC1P18827 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SDC1P18827 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SDC1P18827 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SDC1P18827 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SDC1P18827 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SDC1P18827 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SDC1P18827 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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