Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms