Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTLA4P16410 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTLA4P16410 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTLA4P16410 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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