Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PRG2P13727 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRG2P13727 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms