Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP2AP11388 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP2AP11388 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms