Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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