Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLBP06746 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLBP06746 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLBP06746 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLBP06746 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLBP06746 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLBP06746 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLBP06746 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLBP06746 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms